实验室建设与实验室设计是有联系的，可以说是建设包含了实验室设计。建设主要包括实验室装修、电气工程项目、通排风系统、供水排水系统以及消防系统等方面的设计。实验室的这些建设项目既要符合国家规定的标准，又要方便科研人员进行实验工作。实验室建设的重点工作其实就是要综合考虑实验室的总体规划。鉴于对新型实验室的要求，建设工作应该趋向于智能化、人性化和环保化。
实验室暖通系统：实验室排风涉及实验人员的安全性和舒适性，必须严格控制好排风效果、噪声和节能等因素。通常，为避免实验室内产生的气体交叉污染，实验室气流方向应从低危险区域向高危险区域流动，气流设计应从办公区域，廊道，以及其他辅助区域流入实验室，保持实验室内的适当负压，确保实验室内的气流不外泄到走廊，为保证效果必须采用VAV变风量排风系统。
实验室应有管道排气系统，风向从“洁净区”到“污染区”。排出的空气不再循环至建筑物内的任何其他区域。外部排气口要远离有人区、进风口，否则需经过HEPA过滤。实验人员必须证实进入实验室的风向是正确的。建议在实验室的入口处设置可视的监视装置，表明和证实进风的风向。要考虑安装HVAC控制系统，防止实验室持续正向增压。同时应安装声音报警装置，警告实验人员HVAC系统出了问题。并且至少每年要测试HEPA系统，确保工作正常。
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